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Comment gardez-vous une trace des protocoles de laboratoire passés/nouveaux ?

Comment gardez-vous une trace des protocoles de laboratoire passés/nouveaux ?


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Existe-t-il une liste regroupée par sujet (par exemple « microscopie ») pour garder une trace des protocoles qui ont été conçus et utilisés ?

Le plus proche que j'ai pu trouver est http://www.protocol-online.org/ mais il est assez clairsemé et obsolète.

Des recommandations/trucs et astuces ? Merci!


La meilleure correspondance avec ce que vous recherchez est probablement https://www.protocols.io/, qui héberge des protocoles gratuitement et génère un identifiant d'objet numérique (DOI). Cependant, il n'est pas indexé par PubMed ou d'autres moteurs similaires.

Certaines revues autorisent les articles sur les méthodes, mais pas une proportion élevée (et il semble que vous cherchiez un endroit pour les trouver, pas pour les envoyer).


Le cahier de laboratoire électronique en 2020 : un guide complet

Bonjour, je m'appelle Simon Bungers, et je suis le fondateur et PDG de la société qui développe Labfolder, un cahier de laboratoire électronique construit par des scientifiques, pour des scientifiques.

Bien que je passe habituellement mes journées à être le principal promoteur du cahier de laboratoire électronique que notre équipe a créé, cet article ne concerne PAS Labfolder.

Il s'agit plutôt d'une tentative de créer un guide complet du cahier de laboratoire électronique (ELN), dans l'espoir de permettre aux chercheurs de passer plus facilement du papier au cahier numérique. Après tout, le laboratoire intelligent du futur est numérique.

Remarques

  1. Vers la fin de cet article, je soulignerai 5 cahiers de laboratoire électroniques que vous devriez considérer, et fournissez un modèle de tableau de bord en tant que ressource téléchargeable gratuitement pour vous aider dans votre évaluation ELN.
  2. Si vous souhaitez en savoir plus sur Labfolder, veuillez visiter notre page d'accueil ou regarder la vidéo d'introduction ci-dessous.

Mon expérience personnelle avec le problème de reproductibilité

J'ai décidé de consacrer ma carrière au laboratoire sans papier après avoir passé des années au laboratoire du Max-Planck-Institute of Experimental Medicine, frustré par l'expérience d'enregistrer des expériences dans un cahier de laboratoire papier. A ce jour, je me souviens encore mon premier échec à reproduire une expérience.

Mon chef de groupe est venu me voir et m'a demandé de récupérer une expérience particulière qu'il a réalisée il y a 5 ans.

D'abord, Je devais trouver ce cahier en particulier parmi les centaines que nous avions rangés dans le labo dans plusieurs classeurs… Une demi-heure et un cahier plus tard, j'ai toujours du mal à organiser les informations que j'ai acquises…

Dans mon laboratoire, nous avions d'innombrables classeurs & #8230 (Source de l'image : Harvard School of Public Health)

Il manquait beaucoup de détails et Je ne pouvais même pas déchiffrer l'écriture dans certains cas…

J'ai fini par mettre en place la plupart de la méthodologie à partir de zéro, et bien sûr, je n'ai pas été surpris que mes expériences aient montré des résultats différents de ceux observés il y a 5 ans.

C'était ma première rencontre directe avec le problème de reproductibilité. Si les méthodes d'enregistrement d'expériences complexes sont sujettes à erreur, de sorte que des résultats reproductibles ne peuvent être garantis, Comment pourriez-vous jamais être sûr que vous avez affaire à de vraies informations et non à des informations aléatoires ?

Le cahier de laboratoire électronique fournit l'infrastructure manquante pour l'enregistrement, la récupération et l'intégrité des données.

Cela fait maintenant exactement 10 ans que j'ai commencé en tant que doctorant, mais le paysage n'a pas beaucoup changé depuis. Je parie que vous avez connu des frustrations similaires au cours de vos travaux de recherche.

Certaines des plaintes typiques que j'entends de la part des chercheurs comprennent :

“J'ai besoin de trouver des données brutes d'une expérience que j'ai réalisée il y a des années mais je ne me souviens pas exactement où j'ai stocké ces informations.”

“Je souhaite reproduire une expérience d'un collègue et j'ai besoin d'informations supplémentaires, mais cette personne a déjà quitté notre organisation.”

“Je ne peux pas utiliser les données nécessaires pour poursuivre un projet de groupe, car la personne qui détient l'ensemble de données spécifique est partie en vacances sans transfert complet ou est tombée malade de manière inattendue.”

Ces situations sont très reconnaissables pour le chercheur moyen et ont considérablement augmenté la demande de logiciels ELN. Alors… commençons et discutons de la façon dont vous devriez structurer votre recherche pour trouver le cahier de laboratoire électronique le plus adapté à votre équipe de recherche.


Aperçu des procédures

Choisir un cahier

Dans la plupart des cas, vous pouvez sélectionner un bondir cahier, quadrillé. Un laboratoire d'enseignement peut exiger des pages en double détachables pour faire des copies carbone. Un laboratoire d'ingénierie ou de recherche/développement industriel aura probablement besoin d'un cahier de type spécifique avec des pages prénumérotées et des emplacements pour la date et les signatures de l'enquêteur et du superviseur sur chaque page. Les blocs de papier quadrillé détachable ou les cahiers à reliure spirale sans pages pré-numérotées ne sont pas acceptables. Il doit être impossible de déchirer une page sans laisser de preuves. Il est plus sûr de choisir quelque chose qui est clairement étiqueté comme laboratoire carnet.

Préparation du cahier

Veuillez utiliser un stylo à bille pour toutes les entrées, afin que les marques ne s'effacent pas et ne soient pas effaçables.

Inscrivez votre nom, un numéro de téléphone et/ou une adresse et le nom du projet ou le numéro du cours sur la couverture extérieure du dossier. Mettez ces mêmes informations sur la première page à l'intérieur, ou sur la couverture intérieure avant. Si votre bloc-notes ne comprend pas de section de table des matières pré-étiquetée, réservez les pages suivantes pour une table des matières en étiquetant le haut de chaque page comme table des matières et en numérotant chaque page. Si votre cahier n'a pas de pages prénumérotées, vous pouvez utiliser des chiffres romains en minuscules, comme dans une publication standard. Ensuite, numérotez les pages suivantes avec des chiffres arabes dans l'ordre, et vous êtes prêt à commencer à enregistrer les données.

Quoi saisir

Par-dessus tout, il est essentiel que vous saisissiez toutes les procédures et données directement dans votre cahier en temps voulu, c'est-à-dire pendant que vous effectuez le travail proprement dit. Vos entrées doivent être suffisamment détaillées pour que vous ou quelqu'un d'autre puissiez effectuer toute procédure avec uniquement le cahier comme guide. Peu d'étudiants (et peu de chercheurs d'ailleurs) enregistrent des informations suffisamment détaillées et organisées. L'organisation la plus logique des entrées de cahier est chronologique. Si un enregistrement chronologique approprié est conservé et co-signé par un collègue ou un superviseur, il s'agit d'un enregistrement juridiquement valide. Un tel dossier est nécessaire si vous ou votre employeur devez conserver vos droits sur vos découvertes.

Selon les exigences définies par un enseignant, un superviseur, une entreprise ou autre, vous n'aurez peut-être pas à limiter les entrées de votre cahier aux seules notes de laboratoire. D'un autre côté, un étudiant peut enregistrer vos notes de cours, vos notes de laboratoire, vos idées, vos questions, vos notes de recherche en bibliothèque et vos notes faisant partie de toute préparation préalable au laboratoire. Le strict minimum d'entrées pour un cours de laboratoire académique, pour chaque étude de laboratoire, doit inclure le titre de l'introduction de l'étude de laboratoire et les objectifs, les procédures détaillées et le résumé des données (enregistrées dans le laboratoire lui-même).

Nous enregistrons généralement beaucoup plus d'informations dans un cahier de laboratoire que nous n'en rapporterions dans un document de recherche. Par exemple, dans un article publié, nous ne signalons pas le type de centrifugeuse, le régime, le type de rotor ou la machine utilisée. Cependant, si une procédure échoue, vous voudrez peut-être vérifier que vous avez utilisé le bon régime ou le bon rotor. Peut-être que la centrifugeuse elle-même était mal calibrée. Vous auriez besoin de savoir quelle machine vous avez utilisée. Dans un document de recherche, on ne précise pas quelle personne a effectué quelles tâches, car de telles informations sont inutiles pour un tiers. Cependant, dans le cahier, il est important de noter qui était responsable de quelle procédure. Encore une fois, vous aurez peut-être besoin de ces informations pour dépanner vos expériences.

Faire des entrées

Quelqu'un d'autre peut avoir besoin de consulter votre carnet de temps en temps, veuillez donc rendre vos entrées claires et lisibles.

Lorsque vous effectuez vos premières saisies de la journée, commencez par saisir la date, écrivez le mois ou l'abréviation du mois (par exemple, 5 avril 2004 ou 5 avril 2004, mais pas 4/5/04). L'utilisation de chiffres uniquement peut prêter à confusion. Par exemple, en Europe, le jour précède le mois. Ainsi, le 5 avril 2004 serait écrit comme 5/4/04. Lorsque vous démarrez chaque nouvelle page d'un cahier, saisissez la date à côté du numéro de page. Chaque page doit être numérotée et datée de manière cohérente. La plupart d'entre nous utilisent le coin supérieur droit de chaque page pour la date et le numéro de page.

Selon la conception de votre cahier, vous pouvez choisir d'utiliser ou non le dos des pages. Si vous les laissez vides, mettez-y une ligne d'un coin à l'autre pour annuler tous les espaces vides. Certaines personnes utilisent le dos pour des calculs approximatifs, puis annulent l'espace vide restant. Vous pouvez également décider d'économiser de l'espace (et des arbres) et d'utiliser les deux côtés de chaque page. Évidemment, vous ne pouvez pas utiliser les deux côtés avec des cahiers conçus pour faire des copies en double. Dans les situations où vous remettez des copies à un superviseur, vous devez évidemment commencer chaque nouvelle série d'entrées sur une nouvelle page.

Écrivez un titre pour chaque nouvel ensemble d'entrées. Les ensembles distincts d'entrées doivent être séparés en utilisant des en-têtes informatifs et en laissant un seul espace ou deux entre les ensembles d'entrées individuels. Des informations spécifiques peuvent être plus facilement localisées de cette façon. Pour une nouvelle étude en laboratoire, notez un Très bref introduction à l'étude et énumérer les objectifs. Si vous avez une hypothèse précise, notez-la. L'objectif est d'indiquer clairement ce que vous avez l'intention de faire.

Enregistrez tout ce que vous faites dans le laboratoire, même si vous suivez une procédure publiée. Par exemple, si vous avez commencé par obtenir une quantité de mouchoirs d'un instructeur, notez ensuite que vous avez obtenu des mouchoirs, décrivez-les, notez combien, dans quelle condition, etc. pertinent l'information doit être là. Par exemple, peu importe que vous ayez reçu un morceau de foie dans un seau à glace rouge ou noir. Cependant, il Est-ce que importe que le matériau soit sur la glace. Si vous modifiez un protocole de quelque manière que ce soit ou décidez entre des méthodes alternatives, les informations correctes doivent être enregistrées dans le carnet. Par exemple, un protocole de fractionnement tissulaire peut recommander une centrifugation à 9 400 x g, mais nous pouvons décider d'utiliser 12 000 x g en laboratoire. La force g correcte doit être notée.

Si vous faites une erreur, mettez une ligne à travers l'erreur et écrivez la nouvelle information à côté. Jamais effacer ou effacer une entrée. Lorsque vous avez terminé une page, tracez une ligne de coin à coin à travers toutes les parties vierges qui pourraient encore être utilisées pour la saisie de données. Chaque partie de chaque page doit être lisible et remplie, soit avec des informations, soit avec une marque qui annule la section (voir exemples).

Le résumé

Lorsque vous avez terminé un projet, résumez ce que vous avez accompli. Vous n'avez pas à tirer de conclusions, indiquez simplement le type de données ou d'observations que vous avez collectées, les échantillons que vous avez enregistrés (et où et comment vous les avez enregistrés) ou toute autre information pertinente qui clôture l'étude. Pour une étude continue, gardez le résumé extrêmement bref. En fait, si les notes sont bien organisées et qu'il est évident que l'étude s'est arrêtée, vous n'avez besoin d'écrire rien de plus que "A suivre. " Les résumés aident à maintenir la continuité. Ils indiquent où le travail s'est arrêté et comment il pourrait reprendre.

Organisation

Faire deux choses à la fois ?

Utilisez simplement votre meilleur jugement. Vous pouvez diviser chaque page en colonnes et conserver vos deux enregistrements côte à côte. Vous pouvez dater deux pages consécutives, en conservant les deux enregistrements séparément. Dans les deux cas, lorsque vous quittez le laboratoire pour la journée, rayez les parties inutilisées d'une page qui précèdent la dernière entrée.

Pages de suite

Et si vous avez besoin de plus d'une page pour un projet ? Avec la poursuite des recherches, ce sera toujours le cas. Une bonne utilisation des notes complémentaires permet de suivre votre chemin à travers une longue expérience ou une série d'expériences sans avoir à feuilleter chaque page de votre cahier.

Par exemple, disons que vous avez marqué des échantillons de protéines avec le radio-isotope S-35, analysé un gel et placé le gel dans une cassette de film afin de produire une autoradiographie. Pendant les deux jours où votre film est au congélateur, vous consacrez tout votre temps à un projet de clonage qui s'inscrit dans une étude sans rapport. Après avoir mis votre cassette de film dans le congélateur, écrivez simplement Suite, page ___ , puis entrez la date et le titre de votre autre projet, et continuez à enregistrer les informations.

Lorsque vous reprenez le travail sur les échantillons de protéines, entrez la date, écrivez Suite de la page ___ et entrez vos résultats d'autoradiographie. De cette façon, tout ce que vous faites au laboratoire est enregistré chronologiquement, mais une personne intéressée à suivre vos progrès pourrait commencer depuis le début et suivre chaque procédure sur une seule étude, du début à la fin.

Les choses deviennent-elles trop bâclées ?

Vos enregistrements de données sont peut-être éparpillés dans le cahier et vous souhaitez les résumer. Vas-y. Vous pouvez ressaisir des tableaux ou des chiffres à tout moment pour mieux organiser votre travail. Pour éviter toute confusion sur la duplication des données, vous pouvez mettre une ligne dans un tableau ou une figure que vous avez l'intention de redessiner, parapher et dater le changement, et noter la page sur laquelle les données réorganisées peuvent être trouvées. Il suffit de ne pas masquer l'entrée d'origine.

Procédures répétées

Jusqu'à présent, il vous a été conseillé d'enregistrer chaque étape que vous effectuez dans le laboratoire, que la procédure soit publiée ou non. Cependant, une fois que vous avez effectué une procédure, vous pouvez vous référer à cette partie de votre carnet et noter uniquement les modifications que vous apportez. Par exemple, la première fois que vous préparez un gel de séquençage, vous devez noter la formulation exacte, comment vous mélangez le gel, combien de temps vous le laissez durcir, etc. La prochaine fois, reportez-vous simplement au nom de la procédure et à la page appropriée. (s) de votre cahier.

Matériaux en vrac

Supposons que vous entriez des données brutes dans un ordinateur et que vous ayez une impression avec 400 éléments de données. Ou, supposons que vous génériez un graphique à l'aide d'un logiciel. Vous pourriez même avoir un gel taché d'argent auquel vous souhaitez vous référer fréquemment, ou une photomicrographie à fluorescence qui résume bien vos résultats. Certains enquêteurs préfèrent attacher ces documents au cahier lui-même, mais trop d'éléments de ce type font un cahier bâclé et peuvent stresser la reliure. Les données en vrac doivent être conservées dans un dossier ou un carnet séparé, avec l'emplacement noté dans le livre.

Table des matières

Enregistrez toutes les entrées dans la table des matières au fur et à mesure. Vous pouvez l'organiser comme vous le souhaitez, mais il est conseillé d'inclure plusieurs niveaux dans une table des matières, c'est-à-dire d'indiquer où commence une nouvelle étude et d'inclure des sous-titres pour des parties spécifiques d'une étude, des méthodes, des ensembles de données, etc. est de permettre à quelqu'un (comme un superviseur, un évaluateur ou vous-même dans un an) de trouver quoi que ce soit rapidement. Dressez la liste de chaque ensemble d'entrées avec des dates et des numéros de page. Si vous êtes sérieusement rémanent anal, vous pouvez enregistrer chaque expérience dans l'ordre chronologique, puis utiliser l'espace vide restant pour croiser le contenu expérience par expérience.

Pour un laboratoire d'enseignement, vous pouvez lister chaque ensemble d'entrées faites dans votre cahier, par ordre chronologique, y compris les titres complets et informatifs. Des exemples d'ensembles d'entrées comprennent une introduction, un résumé, un ensemble de procédures pour une préparation spécifique, un ensemble de données complet, des calculs pour la dilution d'échantillons ou la préparation d'étalons de dosage, etc. Un évaluateur doit être capable de trouver n'importe quelle entrée spécifique rapidement, sans feuilleter les pages.


Zone de travail stérile

Le moyen le plus simple et le plus économique de réduire la contamination par les particules en suspension dans l'air et les aérosols (p.

  • La hotte de culture cellulaire doit être correctement installée et située dans une zone réservée à la culture cellulaire, à l'abri des courants d'air des portes, fenêtres et autres équipements, et sans circulation de transit.
  • La surface de travail doit être épurée et ne contenir que les éléments nécessaires à une procédure particulière, elle ne doit pas être utilisée comme zone de stockage.
  • Avant et après utilisation, la surface de travail doit être soigneusement désinfectée et les zones environnantes et l'équipement doivent être nettoyés régulièrement.
  • Pour le nettoyage de routine, essuyez la surface de travail avec de l'éthanol à 70 % avant et pendant le travail, surtout après tout déversement.
  • Vous pouvez utiliser la lumière ultraviolette pour stériliser l'air et les surfaces de travail exposées dans la hotte de culture cellulaire entre les utilisations.
  • L'utilisation d'un bec Bunsen pour le flambage n'est pas nécessaire ni recommandée dans une hotte de culture cellulaire.
  • Laissez la hotte de culture cellulaire en marche à tout moment, en l'éteignant uniquement lorsqu'elles ne seront pas utilisées pendant de longues périodes.

S'assurer que les bénéficiaires se conforment au mandat du NIH de suivre une formation sur la protection des sujets humains.

Les boursiers nationaux et internationaux financés par le NIH qui mènent des recherches sur des sujets humains doivent se conformer à l'exigence du NIH selon laquelle tout le personnel impliqué dans la conception ou la conduite de recherches sur des sujets humains doit recevoir une formation sur la protection des sujets humains.

Cette exigence s'applique à toutes les recherches sur des sujets humains, c'est-à-dire aux classifications de codes de sujets humains exemptés et non exemptés.

Le NIH considère une organisation engagée dans la recherche sur des sujets humains même si une autre organisation effectue les activités sur des sujets humains sur la subvention.

Le NIAID demande la certification de la formation à la protection des sujets humains dans le cadre de la soumission juste-à-temps Voir le SOP juste-à-temps.

La certification de formation sur des sujets humains est valable pour la durée de la bourse.

Consultez les SOP suivantes pour obtenir des informations sur les autres exigences relatives aux sujets humains :

Candidats et bénéficiaires

  • Une formation complète sur la protection des sujets humains pour vous-même et tout le personnel impliqué dans la conception ou la conduite de recherches sur des sujets humains. Pour plus d'informations, consultez la foire aux questions sur l'éducation sur les sujets humains sur le site Web de recherche sur les sujets humains des NIH.
  • Si votre avis d'attribution comprend un terme restrictif sur le travail sur des sujets humains, ne menez aucune recherche sur des sujets humains, même si vous avez terminé votre formation en protection des sujets humains.
  • Pour les nouvelles demandes ou les demandes de renouvellement, fournissez les informations suivantes dans le cadre de vos documents juste-à-temps :
    • Liste de tout le personnel de l'application impliqué dans la conception ou la conduite de la recherche sur des sujets humains, y compris ceux situés dans les sites de consortium, de sous-subvention, de rémunération à l'acte, de consultant ou de performance alternative.

    Personnel du programme

    • Pour les demandes nouvelles ou de renouvellement et les actions administratives :
      • Identifiez les sites de performance engagés dans la recherche sur des sujets humains et confirmez que tout le personnel impliqué a soumis sa documentation.
      • Identifiez toute personne nouvellement récompensée ou nouvellement impliquée dans la conception ou la conduite de recherches sur des sujets humains et assurez-vous que la certification de la formation est incluse dans le rapport d'avancement.

      Personnel des subventions

      • Pour les demandes nouvelles ou de renouvellement et les actions administratives :
        • Identifiez les sites de performance engagés dans la recherche sur des sujets humains et confirmez que tout le personnel impliqué a soumis sa documentation.
        • Si le bénéficiaire ne peut pas se conformer aux exigences de formation sur des sujets humains avant l'attribution, vous pouvez émettre un avis d'attribution en utilisant la période d'attribution restrictive appropriée si cela est autorisé.
        • Examinez l'avis d'attribution précédent et confirmez que toutes les restrictions relatives aux sujets humains ont été prises en compte.
        • Si une période d'attribution restrictive persiste, contactez immédiatement l'AOR pour résoudre et confirmer qu'aucune activité de sujets humains n'a été réalisée pendant la période restreinte.
        • Identifiez toute personne nouvellement récompensée ou nouvellement impliquée dans la conception ou la conduite de recherches sur des sujets humains et assurez-vous que la certification de formation est incluse.

        Le cahier de laboratoire

        Parallèlement à cette structure de répertoires chronologique, je trouve utile de maintenir un cahier de laboratoire organisé chronologiquement. Il s'agit d'un document qui réside à la racine du répertoire des résultats et qui enregistre votre progression en détail. Les entrées dans le bloc-notes doivent être datées et elles doivent être relativement détaillées, avec des liens ou des images intégrées ou des tableaux affichant les résultats des expériences que vous avez effectuées. En plus de décrire précisément ce que vous avez fait, le cahier doit consigner vos observations, conclusions et idées pour des travaux futurs. En particulier lorsqu'une expérience tourne mal, il est tentant de simplement lier le graphique final ou le tableau des résultats et de commencer une nouvelle expérience. Avant de faire cela, il est important de documenter comment vous savez que l'expérience a échoué, car l'interprétation de vos résultats peut ne pas être évidente pour quelqu'un d'autre qui lit votre cahier de laboratoire.

        En plus du texte principal décrivant vos expériences, il est souvent utile de transcrire les notes des conversations ainsi que le texte des e-mails dans le cahier de laboratoire. Ces types d'entrées fournissent une image complète de l'évolution du projet au fil du temps.

        En pratique, je demande aux membres de mon groupe de recherche de mettre en ligne leurs cahiers de laboratoire, derrière une protection par mot de passe si nécessaire. Lorsque je rencontre un membre de mon laboratoire ou d'une équipe de projet, nous pouvons nous référer au cahier de laboratoire en ligne, en nous concentrant sur l'entrée actuelle mais en faisant défiler jusqu'aux entrées précédentes si nécessaire. L'URL peut également être fournie aux collaborateurs distants pour leur donner des mises à jour sur l'état du projet.

        Notez que si vous préférez ne pas créer votre propre carnet électronique « home-brew », plusieurs alternatives sont disponibles. Par exemple, une variété de systèmes logiciels commerciaux ont été créés pour aider les scientifiques à créer et à maintenir des cahiers de laboratoire électroniques [1]–[3]. De plus, en particulier dans le cadre de collaborations, stocker le cahier de laboratoire sur un système basé sur un wiki ou sur un site de blog peut être intéressant.


        Conseils pour une stratégie de recherche réussie

        Lors de la rédaction de votre stratégie de recherche, votre objectif est de présenter une description bien organisée, visuellement attrayante et lisible de votre projet proposé. Cela signifie que votre écriture doit être rationalisée et organisée afin que vos évaluateurs puissent facilement saisir les informations. Si l'écriture n'est pas votre fort, demandez de l'aide.

        Il existe de nombreuses façons de créer un plan de recherche exceptionnel, alors explorez vos options.

        À quoi ressemble le succès

        Le plan de recherche de votre application est la carte qui montre à vos examinateurs comment vous prévoyez de tester votre hypothèse.

        Il expose non seulement vos expériences et les résultats attendus, mais doit également convaincre vos examinateurs de votre succès probable en dissipant tous les doutes qui pourraient leur venir à l'esprit quant à votre capacité à mener la recherche.

        Remarquez dans les exemples de candidatures comment l'écriture garde les yeux des examinateurs sur la balle en les ramenant aux principaux points que les IP veulent faire valoir. Écrivez-vous une police d'assurance contre la faillibilité humaine : si c'est un point clé, répétez-le, puis répétez-le encore.

        Les trois grands

        Alors que vous écrivez, mettez carrément la vue d'ensemble dans votre ligne de mire. Lorsque les évaluateurs liront votre candidature, ils chercheront les réponses à trois questions de base :

        1. Votre recherche peut-elle faire avancer votre domaine ?
        2. Le domaine est-il important ? Le progrès fera-t-il une différence pour la santé humaine ?
        3. Est-ce que vous et votre équipe pouvez effectuer le travail?

        Ajouter de l'emphase

        Les IP avertis créent des opportunités pour faire valoir leurs points principaux. Ils ne s'arrêtent pas à la section Signification pour souligner l'importance de leur projet, et ils regardent au-delà de leurs biosketches pour mettre en évidence l'expertise de leur équipe.

        Ne prenez pas le risque que votre examinateur passe sous silence cette phrase critique enfouie quelque part dans votre stratégie de recherche ou ailleurs. Écrivez-vous une police d'assurance contre la faillibilité humaine : si c'est un point clé, répétez-le, puis répétez-le encore.

        Ajoutez plus d'emphase en mettant le texte en gras, ou italique gras (à l'ère moderne, nous sautons le soulignement - c'est pour les machines à écrire).

        Voici d'autres stratégies de nos IP à succès :

        • En décrivant une méthode dans la section Approche, ils font état de leur expérience ou de celle de leurs collaborateurs avec celle-ci.
        • Ils précisent qu'ils ont accès à un équipement nécessaire.
        • Lorsqu'ils expliquent leur domaine et l'état des recherches en cours, ils tissent leurs propres travaux et leurs données préliminaires.
        • Ils se penchent sur la biologie de la région pour s'assurer que les évaluateurs comprennent l'importance de leurs recherches et comprennent leur domaine et la manière dont leur travail s'y intègre.

        Repérez l'échantillon

        Vous pouvez voir bon nombre de ces principes à l'œuvre dans la section Approche de la demande du Dr William Faubion, "Les cascades inflammatoires perturbent la fonction Treg par des mécanismes épigénétiques."

        • Les évaluateurs ont estimé que les expériences décrites pour l'objectif 1 produiront des résultats clairs.
        • Les plans visant à traduire ces résultats en cibles génétiques pertinentes sont bien définis et ciblés.
        • Il lie ses expériences proposées à l'image plus large, y compris les recherches antérieures et les données préliminaires solides pour l'application actuelle.

        Anticiper les questions des évaluateurs

        Nos candidats n'ont pas seulement écrit en pensant à leurs évaluateurs, ils semblaient anticiper leurs questions. Vous pouvez penser : comment puis-je anticiper toutes les questions que les gens peuvent avoir ? Bien sûr, vous ne pouvez pas, mais il y a quelques éléments de base (en plus des "trois grands" énumérés ci-dessus) qui seront sûrement dans l'esprit de vos examinateurs :

        • Les enquêteurs seront-ils en mesure de faire le travail pendant la période du projet, ou le travail proposé est-il trop ambitieux ?
        • L'IP a-t-il décrit les pièges potentiels et les alternatives possibles ?
        • Les expériences généreront-elles des données significatives ?
        • Les données résultantes pourraient-elles prouver l'hypothèse?
        • Est-ce que d'autres font déjà le travail, ou est-ce qu'il est déjà terminé ?

        Répondez à ces questions, puis passez du temps à réfléchir à d'autres problèmes potentiels spécifiques à vous et à votre recherche, et abordez-les également.


        Axé sur les sciences de la vie

        Au Département des sciences biologiques, vous trouverez des découvertes qui changent la donne et une éducation qui change la vie, du niveau moléculaire au niveau écosystémique. Nous nous concentrons sur certains des défis les plus difficiles de notre temps - lutter contre le cancer, lutter contre les maladies infectieuses, démêler le changement climatique et disséquer la façon dont nous voyons, entendons et interagissons avec notre environnement. Notre recherche et notre érudition changent la vie des gens et la planète.

        Étudier et travailler au sein de notre communauté accueillante de scientifiques de la vie peut être la première étape pour changer votre vie. Vous constaterez que la recherche et les activités universitaires sont étroitement liées au fur et à mesure que les professeurs créent et partagent de nouvelles connaissances.

        La recherche au Département des sciences biologiques contribue au développement d'une médecine personnalisée, à la découverte du fonctionnement du cerveau humain, à la lutte contre les maladies infectieuses, à la compréhension des génomes à des niveaux jamais imaginés et à la compréhension des écosystèmes complexes qui maintiennent notre planète en bonne santé. Nous sommes réactifs aux défis qui apparaissent soudainement et nécessitent une attention immédiate, car nous nous préparons avec persévérance aux moments où nos connaissances peuvent montrer la voie.

        Nous sommes le plus grand département des sciences de la vie de l'Université Purdue avec des programmes diplômants qui couvrent l'ensemble de la biologie :

        Nous pensons que l'éducation et les carrières en STIM devraient être inclusives et accessibles. Nous sommes profondément engagés à encadrer nos étudiants et à les aider à appliquer leurs connaissances et à développer les compétences nécessaires pour devenir des leaders dans la main-d'œuvre scientifique.

        En tant que membre du College of Science, nous avons la capacité de créer des partenariats interdisciplinaires qui encouragent les expériences de recherche de premier cycle et responsabilisent les étudiants diplômés qui travaillent et publient avec des professeurs de renom. La nature diversifiée des sciences biologiques se prête à des collaborations dans les sciences physiques, l'agriculture, l'ingénierie, l'éducation et les sciences informatiques. Les partenariats abondent alors que les chercheurs de tout le campus travaillent ensemble pour résoudre les défis les plus difficiles d'aujourd'hui.


        Protocole d'évaluation

        Nous suivons un processus en plusieurs étapes pour évaluer tout patient considéré comme candidat à un traitement chronique aux opioïdes. (Voir “ Diagramme de flux de la clinique .”) Le patient reçoit une copie de nos politiques de traitement de la douleur chronique et de prescription de médicaments opioïdes et un accord sur les substances contrôlées, qu'il doit signer. De plus, nous obtenons un test de dépistage de drogues dans l'urine et un rapport de l'État du Michigan énumérant les substances contrôlées, le cas échéant, qui ont été prescrites au patient au cours de l'année écoulée. C'est également notre politique que les nouveaux patients doivent fournir les dossiers médicaux des médecins précédents. Une fois que nous avons reçu et examiné les travaux de laboratoire, le rapport et les dossiers médicaux du patient, nous sommes en mesure de prendre une décision éclairée quant à savoir si un patient est éligible pour recevoir un traitement aux opioïdes chroniques dans notre bureau.


        Exemple de laboratoire d'osmose 2

        Introduction:
        L'énergie cinétique, une source d'énergie stockée dans les cellules, fait que les molécules se heurtent et se déplacent dans de nouvelles directions. La diffusion est le résultat de ce contact. La diffusion est le mouvement aléatoire de molécules vers une zone de concentration plus faible à partir d'une zone de concentration plus élevée. L'osmose est un type de diffusion. Il s'agit de la diffusion de l'eau à travers une membrane sélectivement perméable d'une région à potentiel hydrique plus élevé vers une région à potentiel hydrique plus faible. Le potentiel de l'eau est la mesure de l'énergie libre de l'eau dans une solution. Un système vivant contient également un transport actif pour créer un mouvement de particules comme des ions qui se déplacent contre leur gradient de concentration. La source d'énergie ATP est utilisée au cours de ce processus pour déplacer les particules à travers la membrane cellulaire. Cette expérience a pour but de mesurer la diffusion de petites molécules à travers des tubes de dialyse. Ce tube agit comme une membrane sélectivement perméable, permettant aux molécules plus grosses de passer à travers, mais lentement. La dialyse est le mouvement d'un soluté à travers une membrane sélectivement perméable.

        Lorsque les deux solutions de part et d'autre de la membrane sont égales et qu'aucun mouvement net n'est détecté, les solutions sont isotoniques. Cela signifie que les solutions ont la même concentration de solutés. Si deux solutions diffèrent par la concentration de solutés que chacune a, celle avec plus de soluté est hypertonique. La solution qui a moins de soluté est hypotonique.

        Le potentiel hydrique prédit le mouvement de l'eau à l'intérieur ou à l'extérieur des cellules végétales. Il est abrégé par la lettre grecque psi et comporte deux composants : un composant de pression physique, le potentiel de pression, et les effets des solutés, le potentiel de soluté. L'eau se déplace toujours d'une zone de potentiel hydrique élevé à faible. L'équation est que le potentiel de l'eau est égal à la somme du potentiel de pression et du potentiel de soluté.

        Dans une cellule végétale, la pression de turgescence est nécessaire. Il s'agit d'une pression disponible pour les plantes dans un environnement hypotonique. La pression de turgescence donne aux plantes leur structure et leur force. Lorsqu'une cellule végétale est dans une solution isotonique, la pression de turgescence diminue, provoquant le flétrissement de la structure de la plante. Dans les solutions hypertoniques, la membrane plasmique des plantes se rétracte de la paroi cellulaire, une action appelée plasmolyse.

        Hypothèse:
        La diffusion et l'osmose se produisent entre différentes solutions molaires jusqu'à ce que les solutions soient isotoniques, ce qui affecte la pression de turgescence des cellules végétales.

        Matériaux:
        Laboratoire 1A - Les matériaux utilisés pour mener cette expérience sont les suivants : une bande de 30 cm de tube de dialyse (prétrempé), de l'eau distillée, une solution de glucose à 15 %/1% d'amidon, un bécher de 250 mL, une solution d'iodure de potassium et d'iode, une bande de test de glucose et une ficelle.

        Laboratoire 1B – The materials used in conducting this experiment are as follows: six presoaked strips of dialysis tubing, distilled water, 0.2M, 0.4M, 0.6M, 0.8M, and 1.0M solutions of sucrose, six 250mL glass beakers, string, and an electronic balance.

        Lab 1C – The materials used in conducting this experiment are as follows: six 250mL glass beakers, a potato, a core borer, a knife, distilled water, , 0.2M, 0.4M, 0.6M, 0.8M, and 1.0M solutions of sucrose, string, a ruler, and an electronic balance.

        Lab 1D – The materials used in conducting this experiment are as follows: graph paper, pencil, a ruler, a calculator, and colored pencils.

        Lab 1E – The materials used in conducting this experiment are as follows: a light microscope, microscope slide, cover slip, distilled water, NaCl solution, paper, pencil, and onion skin.

        Procedure:
        Lab 1A: Obtain a 30cm piece of dialysis tubing that has been presoaked in distilled water. Tie off one end securely. Open the other end of the dialysis tube and insert 15mL of 15%glucose/1%starch solution. Tie off the other end of the bag, leaving room for expansion. Record the color of the solution within the bag. Test the 15%glucose/1%starch solution for the presence of glucose using Testape. Fill a 250mL beaker with distilled water and add approximately 4mL of Lugol’s solution (IKI) to the distilled water. Test this solution for the presence of glucose as well with the Testape. Record the results in the data table. Immerse the bag in the beaker of solution. Let this stand for approximately 30min, or until distinct coloration is observed. Record final colors of solutions in the bag and in the beaker. Test both solutions once more for the presence of glucose with the Testape strips.

        Lab 1B: Before starting this lab, wash your hands. Obtain six 30cm dialysis strips that have been presoaked in distilled water. Tie off each end securely. Pour approximately 25mL of each sucrose molar solution into its respective bags (that should be labeled, but not on the tubing itself). Tie off the other ends securely with string, careful to get any air bubbles out and leaving room for expansion. Rinse off each bag and blot off the water. Weigh and record the initial mass of the dialysis bags in the data table. Fill six 250mL glass beakers 2/3 full of distilled water and label each beaker with its respective bag’s molarity of sucrose. Immerse each bag into the distilled water. Allow this to stand for thirty minutes. Remove each bag, blot the sides to get off extra solution and weigh and record mass in grams each bag and determine the mass difference and percent change in mass. Next, compare the group percentages to the class.

        Lab 1C: Pour 100mL of the assigned sucrose solutions into their 250mL beakers (pre-labeled). Obtain a large potato. Using a core borer, take 24 samples out of the potato, and measure each in centimeters so that they are all equal in length (use the knife to slice off ends). Make sure not to leave any skin with the samples. Place these cores in a covered beaker until an electronic balance can be obtained. Determine the mass of four cores at a time, placing the four in their sucrose solutions. Record this data for each of the six beakers. Allow these potato samples to sit immersed in the solutions overnight, covered. Remove the cores, blot off excess solution, and weigh the samples, recording the mass in the data table. Determine the mass difference, the percent change in mass and the class average percent change in mass. Graph the increase and decrease in mass of the potato cores according to the molarity of the solutions they were placed in on graph 1.2.

        Lab 1D: Using paper, a pencil, and a calculator determine the solute potential of the sucrose solution, the pressure potential, and the water potential. Also, obtain graph paper and graph the values given for the zucchini percent change in mass and molarity of sucrose solutions in the graph 1.3.

        Lab 1E: Prepare a wet mount slide of onion skin. Observe under a light microscope and sketch what you see. Add a few drops of the NaCl solution, observe, and sketch what you see there as well.

        Data:
        Table 1.1 The presence of glucose in beaker and bag solutions