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Où puis-je trouver l'exécutable FDist2 ?

Où puis-je trouver l'exécutable FDist2 ?


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J'essaie de télécharger le programme FDist2 (Beaumont et Nichols 1996) pour Mac mais pour une raison quelconque, il semble que tous les liens que je trouve soient rompus.

Il semble que le programme Lositan soit une implémentation plus rapide de FDist2, mais à ma connaissance, Lositan ne fonctionne que via une interface graphique et non via la ligne de commande (et étant donné le nombre d'analyses que je souhaite effectuer, je dois pouvoir exécuter cet algorithme à partir du ligne de commande).


Le lien que ddiez a mentionné, a un lien de téléchargement pour un fichier zip (fidist2). Le fichier zip contient des exécutables Windows et des codes C. Compilez simplement les codes C dans votre terminal.

C'est tiré du readme :

Les fichiers .exe sont des binaires de PC, ce qui n'est que ce que la plupart des gens veulent. J'inclus le fichier source au cas où quelqu'un voudrait jouer avec. Dans ce cas, la compilation est par exemple :

gcc -o fdist2 -O fdist2.c -lm gcc -o cplot -O cplot.c as100.c as99.c -lm gcc -o datacal -O datacal.c -lm

En fait, dans le fichier readme, la première commande de compilation ditfdist.c(pas de tel fichier) au lieu defdist2.c. J'ai corrigé ça ici.

Votre système doit avoirgcc. J'ai essayé de compiler dans mon système (linux) et cela fonctionne. Cela devrait aussi fonctionner sur Mac.


Lotterhos et Whitlock 2014 ont recodé fdist2 en R et il peut être trouvé ici sur Dryad.


Vous essayez probablement d'exécuter un binaire 32 bits sur un système 64 bits sur lequel la prise en charge 32 bits n'est pas installée.

Il y a trois cas où vous pouvez obtenir le message « No such file or directory » :

  • Le fichier n'existe pas. Je suppose que vous avez vérifié que le fichier existe (peut-être parce que le shell le termine).
  • Il existe un fichier portant ce nom, mais c'est un lien symbolique suspendu.
  • Le fichier existe, et vous pouvez même le lire (par exemple, le fichier de commande shank-linux-120720110-1-bin affiche quelque chose comme « ELF 32-bit LSB exécutable … »), et pourtant, lorsque vous essayez de l'exécuter, vous on me dit que le fichier n'existe pas.

Le message d'erreur dans ce dernier cas est certes déroutant. Ce qu'il vous dit, c'est qu'un composant clé de l'environnement d'exécution nécessaire à l'exécution du programme est manquant. Malheureusement, le canal par lequel l'erreur est signalée n'a de place que pour le code d'erreur et non pour cette information supplémentaire que c'est vraiment l'environnement d'exécution qui est à blâmer. Si vous voulez la version technique de cette explication, lisez le message Obtenir « Introuvable » lors de l'exécution d'un binaire 32 bits sur un système 64 bits.

La commande file vous dira ce qu'est ce binaire. À quelques exceptions près, vous ne pouvez exécuter qu'un binaire pour l'architecture de processeur pour laquelle votre version d'Ubuntu est destinée. La principale exception est que vous pouvez exécuter des binaires 32 bits (x86, alias IA32) sur des systèmes 64 bits (amd64, alias x86_64).

Dans Ubuntu jusqu'à 11.04, pour exécuter un binaire 32 bits sur une installation 64 bits, vous devez installer le paquet ia32-libs . Vous devrez peut-être installer des bibliothèques supplémentaires (vous obtiendrez un message d'erreur explicite si vous le faites).

Depuis que la 11.10 (oneiric) a introduit le support multiarch, vous pouvez toujours installer ia32-libs , mais vous pouvez choisir une approche plus fine, c'est suffisant pour obtenir libc6-i386 (plus toute autre bibliothèque nécessaire).


Résumé

L'analyse de la diversité génétique au sein des espèces est vitale pour comprendre les processus évolutifs au niveau des populations et au niveau génomique. Une grande quantité de données peut désormais être produite à un rythme sans précédent, nécessitant l'utilisation de programmes informatiques dédiés pour extraire toutes les informations embarquées. Plusieurs progiciels statistiques ont été récemment développés, qui offrent un panel d'analyses standards et plus sophistiquées. Nous décrivons ici les fonctionnalités, les caractéristiques spéciales et les hypothèses de plus de 20 de ces programmes, indiquons comment ils peuvent interagir et discutons de nouvelles orientations qui pourraient conduire à des logiciels et des analyses améliorés.


J'ai eu du succès avec Sysinternals Process Explorer. Avec cela, vous pouvez rechercher pour trouver quel(s) processus ont un fichier ouvert, et vous pouvez l'utiliser pour fermer le(s) handle(s) si vous le souhaitez. Bien sûr, il est plus sûr de fermer l'ensemble du processus. Faites preuve de prudence et de jugement.

Pour rechercher un fichier spécifique, utilisez l'option de menu Find->Find Handle ou DLL. Tapez une partie du chemin d'accès au fichier. La liste des processus apparaîtra ci-dessous.

Si vous préférez la ligne de commande, la suite Sysinternals inclut l'outil de ligne de commande Handle, qui répertorie les descripteurs ouverts.

  • c:Program FilesSysinternalsSuite&ghandle.exe |findstr /i "e:" (trouve tous les fichiers ouverts à partir du lecteur e: "
  • c:Program FilesSysinternalsSuite&ghandle.exe |findstr /i "fichier-ou-chemin-en-question"

Vous pouvez utiliser le Moniteur de ressources pour ce qui vient intégré avec Windows 7, 8 et 10.

  1. Ouvert Moniteur de ressources, que l'on trouve
    • En recherchant Moniteur de ressources ou resmon.exe dans le menu Démarrer, ou
    • Comme un bouton sur le Performance onglet dans votre Gestionnaire des tâches
  2. Allez au CPU languette
  3. Utilisez le champ de recherche dans le Poignées associées section
    • Voir la flèche bleue dans la capture d'écran ci-dessous

Lorsque vous avez trouvé le descripteur, vous pouvez identifier le processus en regardant la colonne Image et/ou PID.

Vous pouvez ensuite essayer de fermer l'application comme vous le feriez normalement, ou, si ce n'est pas possible, faites simplement un clic droit sur le handle et arrêtez le processus directement à partir de là. Peasy facile!

Soyez juste très prudent avec la fermeture des descripteurs, c'est encore plus dangereux que vous ne le pensez, à cause du recyclage des descripteurs - si vous fermez le descripteur de fichier et que le programme ouvre quelque chose d'autre, ce descripteur de fichier original que vous avez fermé peut être réutilisé pour ce "quelque chose d'autre. " Et maintenant, devinez ce qui se passe si le programme continue, pensant qu'il travaille sur le fichier (dont vous avez fermé le handle), alors qu'en fait ce handle de fichier pointe maintenant vers autre chose.

Supposons qu'un service d'indexation de recherche ait un fichier ouvert pour l'indexation mais qu'il soit temporairement bloqué et que vous souhaitiez supprimer le fichier, vous forcez donc (imprudemment) la fermeture du handle. Le service d'index de recherche ouvre son fichier journal afin d'enregistrer certaines informations et le descripteur du fichier supprimé est recyclé en tant que descripteur du fichier journal. L'opération bloquée se termine enfin et le service d'index de recherche parvient enfin à fermer le descripteur qu'il avait ouvert, mais il finit par fermer involontairement le descripteur de fichier journal.

Le service d'index de recherche ouvre un autre fichier, par exemple un fichier de configuration pour l'écriture afin qu'il puisse mettre à jour un état persistant. Le descripteur du fichier journal est recyclé en tant que descripteur du fichier de configuration. Le service d'index de recherche souhaite enregistrer certaines informations, il écrit donc dans son fichier journal. Malheureusement, le descripteur du fichier journal a été fermé et le descripteur réutilisé pour son fichier de configuration. Les informations enregistrées vont dans le fichier de configuration, le corrompant.

Pendant ce temps, un autre handle que vous avez forcé à fermer a été réutilisé comme handle mutex, qui est utilisé pour empêcher la corruption des données. Lorsque le descripteur de fichier d'origine est fermé, le descripteur mutex est fermé et les protections contre la corruption des données sont perdues. Plus le service s'exécute longtemps, plus ses index sont corrompus. Finalement, quelqu'un remarque que l'index renvoie des résultats incorrects. Et lorsque vous essayez de redémarrer le service, il échoue car ses fichiers de configuration ont été corrompus.

Vous signalez le problème à la société qui fournit le service d'index de recherche et ils déterminent que l'index a été corrompu, que le fichier journal a mystérieusement arrêté la journalisation et que le fichier de configuration a été écrasé par des ordures. Un pauvre technicien se voit confier la tâche désespérée de comprendre pourquoi le service corrompt ses index et ses fichiers de configuration, sans savoir que la source de la corruption est que vous avez forcé un handle fermé.


Assurez-vous d'avoir rejoint votre section de classe en ligne.

Connectez-vous à My AP avec votre compte College Board et assurez-vous d'avoir rejoint votre section de classe. Si ce n'est pas le cas, vous devrez suivre les étapes pour rejoindre votre section en ligne.

Enregistrez-vous ou confirmez votre enregistrement existant dans My AP.

Si votre école vous demande d'indiquer votre inscription à l'examen, vous verrez un bouton S'inscrire dans la vue de la section de votre classe dans Mon AP après avoir rejoint vos sections de classe. En cliquant sur ce bouton, votre coordinateur saura que vous envisagez de passer l'examen et il le commandera pour vous. Si vous ne voyez pas ce bouton, cela signifie que vous avez déjà été automatiquement inscrit à l'examen.

Si vous souhaitez vous inscrire à un examen après novembre, votre commande peut être soumise à des frais de retard. Vous devrez demander à votre coordinateur AP de mettre à jour votre inscription. Si votre cours ne commence pas avant le printemps ou si vous avez été transféré dans une nouvelle école après la date limite de commande des examens, ne vous inquiétez pas : votre coordinateur pourra commander votre examen et vous ne serez pas facturé pour une commande tardive. frais.

Discutez avec le coordinateur AP de votre école du paiement des frais d'examen.

Vous ne pouvez pas payer votre examen sur ce site Web. Votre coordinateur AP percevra tous les frais que vous devez.

Mise à jour pour 2020-21 : En raison des circonstances inhabituelles de cette année, les frais d'examen non utilisés/annulés ne seront pas appliqués cette année. Inscrivez-vous à vos examens avant la date limite indiquée par votre école. C'est le meilleur moyen de garder vos options ouvertes, car si votre situation change et que vous décidez finalement de ne pas passer vos examens en 2021, nous ne facturerons pas votre école pour ces examens. Cependant, les frais de retard de commande s'appliquent toujours cette année si vous décidez après la date limite de commande que vous souhaitez passer un examen.

En savoir plus sur les frais d'examen AP, les politiques de frais et les réductions de frais.

Vérifiez les détails de votre inscription.

Une fois que vous avez choisi de vous inscrire, la date et l'heure de votre examen apparaîtront dans la section de votre classe dans Mon AP. Si votre coordinateur AP vous propose une date d'examen numérique au lieu d'une date d'examen papier-crayon, cela sera reflété dans Mon AP. Les examens papier et crayon et les examens numériques ont des heures de début différentes. Vous pouvez consulter le calendrier des examens et parler avec votre coordinateur AP si vous avez des questions sur l'heure de début de l'examen que vous devez passer.

Votre coordinateur AP vous informera quand et où vous présenter aux examens. Si vous passez un examen numérique, votre coordinateur AP confirmera si vous passerez le test à l'école ou à la maison.

Puis-je m'inscrire pour repasser un examen AP ?

Les examens AP ne sont donnés qu'une fois par an, mais vous pouvez répéter un examen l'année suivante. Si vous le faites, les deux scores seront rapportés à moins que vous ne demandiez qu'un seul soit retenu ou annulé.

Si un problème ou un incident survient pendant votre examen AP, vous pourriez être admissible à un examen de rattrapage pendant l'administration en cours. Si vous devez passer un examen AP sur papier de maquillage ou un examen AP chinois ou AP japonais, votre coordinateur AP devra soumettre la demande de commande. Si vous devez passer un examen AP numérique de maquillage, vous pouvez soumettre une demande via My AP. Passez en revue les détails sur la soumission d'une demande d'examen numérique de maquillage.

Combien de fois puis-je repasser un examen AP ?

Vous pouvez passer un examen AP chaque fois qu'il est proposé. Les examens sont administrés une fois par an en mai. Votre rapport de score inclura vos scores pour tous les examens AP que vous avez passés, à moins que vous ne demandiez qu'un ou plusieurs scores soient retenus ou annulés.

Si un problème ou un incident survient pendant votre examen AP, vous pourriez être admissible à un examen de rattrapage pendant l'administration en cours. Si vous devez passer un examen AP sur papier de maquillage ou un examen AP chinois ou AP japonais, votre coordinateur AP devra soumettre la demande de commande. Si vous devez passer un examen AP numérique de maquillage, vous pouvez soumettre une demande via My AP. Passez en revue les détails sur la soumission d'une demande d'examen numérique de maquillage.

L'examen AP que je souhaite passer n'est pas proposé dans mon école. Que dois-je faire?

Si votre école n'offre pas l'examen que vous souhaitez passer, vous devrez prendre des dispositions pour passer l'examen dans une école locale qui l'administre.

Votre première étape consiste à rechercher le grand livre de cours AP. Le registre de cours AP est la liste officielle, à jour et complète des écoles qui ont réussi l'audit de cours AP. Vous pouvez effectuer une recherche par pays, état/province ou ville pour trouver une école où vous pourriez être en mesure de passer un test. Après avoir trouvé des écoles près de chez vous qui proposent le ou les cours pour lesquels vous souhaitez passer des examens, effectuez une recherche sur Internet pour le numéro de téléphone principal de l'école. Ensuite, appelez et demandez à parler au coordinateur AP de l'école pour savoir si l'école prévoit d'autoriser les élèves scolarisés à la maison à y passer les tests cette année.

Les élèves doivent être inclus dans l'ordre des examens d'une école au plus tard le 12 mars. Notez que les écoles peuvent avoir leurs propres délais et politiques locaux pour recevoir les demandes d'étudiants extérieurs à tester dans leur école - en particulier cette année pendant la pandémie en cours - vous voudrez donc vous donner autant de temps que possible pour contacter les écoles. Des mises à jour seront apportées au registre des cours AP pour 2020-21 en novembre, donc si vous avez encore besoin de trouver des écoles possibles, vous pouvez vérifier à nouveau le registre en novembre pour voir si des écoles de votre région ont été ajoutées.

Lorsque vous trouvez un coordinateur AP capable d'administrer votre ou vos examens AP, il est chargé de commander votre matériel d'examen, de vous dire quand et où vous présenter aux examens et de percevoir les frais d'examen.

Que se passe-t-il si deux examens auxquels je souhaite m'inscrire sont programmés à la même date et à la même heure ?

Si deux des examens que vous souhaitez passer sont programmés pour la même heure, demandez à votre coordinateur AP des informations sur la façon de passer l'un des examens pendant la période de test tardif. Vous pouvez toujours vous inscrire pour les deux.

Puis-je m'inscrire à un examen AP si mon école n'offre pas de cours AP ou n'administre pas d'examens AP ?

Oui. Vous ne pouvez pas commander les examens AP directement, mais vous devriez pouvoir vous organiser pour passer des examens dans un lycée voisin qui administre les examens AP. Voici comment.

Votre première étape consiste à rechercher le grand livre de cours AP. Le registre de cours AP est la liste officielle, à jour et complète des écoles qui ont réussi l'audit de cours AP. Vous pouvez effectuer une recherche par pays, état/province ou ville pour trouver une école où vous pourriez être en mesure de passer un test. Après avoir trouvé des écoles près de chez vous qui proposent le ou les cours pour lesquels vous souhaitez passer des examens, recherchez sur Internet le numéro de téléphone principal de l'école. Ensuite, appelez et demandez à parler au coordinateur AP de l'école pour savoir si l'école prévoit d'autoriser les élèves scolarisés à la maison à y passer les tests cette année.

La date limite de commande des examens sera prolongée jusqu'au 12 mars pour tous les étudiants incapables de trouver une école pour commander un examen AP pour eux avant le 13 novembre. Au début de 2021, nous partagerons les détails d'une option de test d'urgence pour les étudiants qui ne peuvent pas tester dans une école.

Notez que les écoles peuvent avoir leurs propres délais et politiques locaux pour recevoir les demandes d'étudiants extérieurs à tester dans leur école - en particulier cette année pendant la pandémie en cours - vous voudrez donc vous donner autant de temps que possible pour contacter les écoles. Des mises à jour seront apportées au registre des cours pour 2020-21 en novembre, donc si vous avez encore besoin de trouver des écoles possibles, vous pouvez vérifier à nouveau le registre en novembre pour voir toutes les écoles de votre région ont été ajoutées.

Lorsque vous trouvez un coordinateur AP capable d'administrer votre ou vos examens AP, il est chargé de commander votre matériel d'examen, de vous dire quand et où vous présenter aux examens et de percevoir les frais d'examen.

Puis-je m'inscrire à un examen AP si je ne vis pas aux États-Unis ?

De nombreuses écoles à travers le monde proposent des examens AP. Si votre école ne le fait pas et que vous souhaitez vous inscrire à un examen, veuillez consulter les étapes pour trouver des écoles secondaires et des écoles en ligne qui proposent des cours AP autorisés pour trouver une autre école pour les tests ou passer les examens dans un centre de test AP local.

Si vous vous inscrivez aux examens AP en Inde sans avoir accès aux cours AP de votre école, visitez AP en Inde. Pour les étudiants en Chine, veuillez visiter AP en Chine. Vous pouvez également trouver des centres de test autorisés par le programme AP à Hong Kong, en Corée du Sud et à Singapour.

Je suis scolarisé à la maison. Comment puis-je passer un examen AP ?

Si vous êtes scolarisé à la maison ou si vous fréquentez une école qui n'administre pas les examens AP, vous devrez vous organiser pour passer les examens dans une école locale qui les administre.

Votre première étape consiste à rechercher le grand livre de cours AP. Le registre de cours AP est la liste officielle, à jour et complète des écoles qui ont réussi l'audit de cours AP. Vous pouvez effectuer une recherche par pays, état/province ou ville pour trouver une école où vous pourriez être en mesure de passer un test. Après avoir trouvé des écoles près de chez vous qui proposent le ou les cours pour lesquels vous souhaitez passer des examens, effectuez une recherche sur Internet pour le numéro de téléphone principal de l'école. Ensuite, appelez et demandez à parler au coordinateur AP de l'école pour savoir si l'école prévoit d'autoriser les élèves scolarisés à la maison à y passer les tests cette année.

La date limite de commande des examens sera prolongée jusqu'au 12 mars pour tous les élèves scolarisés à domicile incapables de trouver une école pour commander un examen AP pour eux avant le 13 novembre. Au début de 2021, nous partagerons les détails d'une option de test d'urgence pour les étudiants qui ne peuvent pas tester dans une école.

Notez que les écoles peuvent avoir leurs propres délais et politiques locaux pour recevoir les demandes d'étudiants extérieurs à tester dans leur école - en particulier cette année pendant la pandémie en cours - vous voudrez donc vous donner autant de temps que possible pour contacter les écoles. Des mises à jour seront apportées au registre des cours AP pour 2020-21 en novembre, donc si vous avez encore besoin de trouver des écoles possibles, vous pouvez vérifier à nouveau le registre en novembre pour voir si des écoles de votre région ont été ajoutées.

Lorsque vous trouvez un coordinateur AP capable d'administrer votre ou vos examens AP, il est chargé de commander votre matériel d'examen, de vous dire quand et où vous présenter aux examens et de percevoir les frais d'examen.

J'ai un handicap. Puis-je utiliser des hébergements lorsque je passe un examen AP ?

Si vous avez un handicap documenté, vous pouvez être admissible à des aménagements pour les examens AP. En savoir plus sur les tests d'hébergement pour les examens AP et contactez le coordinateur AP de votre école.


Où puis-je trouver l'exécutable FDist2 ? - La biologie

ELPH est un échantillonneur Gibbs à usage général pour trouver des motifs dans un ensemble de séquences d'ADN ou de protéines. Le programme prend en entrée un ensemble contenant de quelques dizaines à des milliers de séquences et y recherche le motif le plus courant, en supposant que chaque séquence contient une copie du motif. Nous avons utilisé ELPH pour trouver des modèles tels que les sites de liaison du ribosome (RBS) et les amplificateurs d'épissage d'exons (ESE). Voir ci-dessous pour obtenir des instructions sur le téléchargement du système complet, y compris le code source.
Un outil en ligne qui utilise la sortie ELPH pour identifier les amplificateurs d'épissage d'exons peut être trouvé ici.

Configuration requise

ELPH est publié en tant que code source et a été testé sur Linux RedHat 6.x+, Sun Solaris et Alpha OSF1, mais devrait fonctionner sur n'importe quel système Unix.

Obtention de l'ELPH

Pour télécharger le système ELPH complet, il suffit de cliquer ici .

Après le téléchargement, décompressez le fichier de distribution en tapant :

Un répertoire nommé 'ELPH/' sera créé et contiendra l'exécutable, les ensembles de données d'apprentissage et d'autres fichiers de support.


  1. Accédez au site de téléchargement ffmpeg et téléchargez le fichier zip qui correspond le mieux aux spécifications de votre ordinateur. Choisissez le lien "static" et la version "nightly git" pour la convivialité la plus récente.
  2. Créez un dossier sur votre ordinateur pour décompresser le fichier zip. Ce dossier sera votre dossier "installation". J'ai choisi C:Program Filesffmpeg . C'est une bonne idée car vous traiterez cela comme un programme régulier. Décompressez le fichier zip dans ce dossier.
  3. Le dossier doit maintenant contenir un certain nombre d'autres dossiers, y compris un dossier intitulé où ffmpeg.exe est enregistré. Nous n'avons pas encore fini. Double-cliquer sur ce fichier ne fait rien. N'oubliez pas qu'il s'agit d'un programme en ligne de commande. Il fonctionne en cmd .
  4. Avant de pouvoir utiliser ffmpeg.exe dans cmd, vous devez indiquer à votre ordinateur où il peut le trouver. Vous devez ajouter un nouveau chemin système. Tout d'abord, cliquez avec le bouton droit sur Ce PC (Windows 10) ou Ordinateur (Windows 7), puis cliquez sur Propriétés > Paramètres système avancés > Onglet Avancé > Variables d'environnement .
  5. Dans la fenêtre Variables d'environnement, cliquez sur la ligne "Chemin" sous la colonne "Variable", puis cliquez sur Modifier
  6. La fenêtre "Modifier la variable d'environnement" est différente pour Windows 10 et 7. Dans Windows 10, cliquez sur Nouveau, puis collez le chemin d'accès au dossier que vous avez créé précédemment où ffmpeg.exe est enregistré. Pour cet exemple, c'est C:Program Filesffmpegin ![Ajouter un nouveau chemin système Windows 10]]3 Dans Windows 7, toutes les variables sont répertoriées dans une seule chaîne, séparées par un point-virgule. Allez simplement à la fin de la chaîne, tapez un point-virgule ( ), puis collez le chemin.
  7. Cliquez sur OK sur toutes les fenêtres que nous venons d'ouvrir.

ffmpeg est maintenant "installé". L'invite de commande reconnaîtra désormais les commandes ffmpeg et tentera de les exécuter. (Si vous rencontrez toujours des problèmes avec l'invite de commande ne reconnaissant pas ffmpeg, essayez d'exécuter CMD en tant qu'administrateur. Vous pouvez également utiliser Windows Powershell au lieu de cmd. Si cela ne fonctionne toujours pas, vérifiez que chaque étape a été suivie jusqu'à la fin.)


Où puis-je trouver l'exécutable FDist2 ? - La biologie

Les binaires compilés (pour Mac, Windows et Linux) sont disponibles à partir du référentiel FigTree GitHub.

Figuier

FigTree est conçu comme un visualiseur graphique d'arbres phylogénétiques et comme un programme de production de figures prêtes à être publiées. Comme pour la plupart de mes programmes, il a été écrit pour mes propres besoins, il n'est donc peut-être pas aussi raffiné et complet qu'un programme commercial. En particulier, il est conçu pour afficher des arbres résumés et annotés produits par BEAST.

Les binaires compilés (pour Mac, Windows et Linux) sont disponibles à partir du référentiel FigTree GitHub.

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Cette liste de diffusion est réservée aux annonces de nouvelles versions de FigTree.

Historique des versions

Les binaires compilés (pour Mac, Windows et Linux) sont disponibles à partir du référentiel FigTree GitHub.


Linux/BSD

  1. Téléchargez et installez Python 2.4 ou supérieur, de préférence 2.5+
  2. Si vous utilisez Python 2.4, téléchargez et installez également le module ctypes
  3. Téléchargez et décompressez la suite complète SUNDIALS.
  4. $ ./configure --enable-shared
  5. $ make && make install
  6. Télécharger et décompresser PySUNDIALS
  7. Accédez au répertoire où vous avez décompressé PySUNDIALS
  8. $ python setup.py installer

Windows utilisant MinGW

  1. Téléchargez et installez Python 2.5 ou supérieur, en utilisant les binaires Windows
  2. Téléchargez et décompressez la suite complète SUNDIALS quelque part dans MSys.
  3. Faire ne pas lancez aclocal, autoconf ou autoheader, ou les makefiles se briseront !
  4. $ ./configure --enable-shared
  5. $ make && make install
  6. Télécharger et décompresser PySUNDIALS
  7. Accédez au répertoire où vous avez décompressé PySUNDIALS
  8. $ python setup.py -c mingw32 installer

Si vous recevez une erreur de compilation lors de l'exécution de la commande finale, qui se plaint de l'absence de sundials_conf.h ou d'autres fichiers .h manquants, définissez la variable d'environnement CPATH pour qu'elle pointe vers le répertoire contenant les répertoires d'inclusion des cadrans solaires, par exemple

Notez que l'utilisation de MSys présente des problèmes uniques étant un environnement hybride. Nous vous recommandons d'utiliser MSys uniquement pour compiler et installer (Py)SUNDIALS, et non pour l'utiliser comme environnement dans lequel exécuter PySUNDIALS. Après avoir suivi les instructions ci-dessus, les bibliothèques partagées SUNDIALS seront dans %MSYSROOT%/usr/local/lib/ et se termineront par '-<digit>.exe'. Sur les anciennes versions de MSys/MinGW, l'extension '.exe' peut être omise.


Où puis-je trouver l'exécutable FDist2 ? - La biologie

Laboratoire pour

Biochimie des systèmes

Bienvenue au Wühr Lab !

Le Wühr Lab est situé dans l'Institut Lewis-Sigler de l'Université de Princeton. Nous visons à élucider les principes par lesquels les molécules s'auto-organisent en organites et cellules beaucoup plus grandes. Plus précisément, nous étudions comment les protéines se répartissent entre le noyau et le cytoplasme et comment différentes compositions nucléaires affectent la fonction cellulaire. Pour répondre à ces questions, nous développons et utilisons la protéomique quantitative en combinaison avec des approches informatiques, biochimiques et d'imagerie.

Le Wühr Lab (de haut à gauche en bas à droite) : Michael Stadlmeier, Martin Wühr, Audrey Zhu, Alex Johnson, Lillia Ryazanova, Eli Costa, Alex Frese, Chirag Kumar, Heide Baron, Donovan Cassidy-Nolan, Bhoomika Chowdhary, Meera Gupta, Felix Keber, Nishant Pappireddi, Thao Nguyen, Joseph Crapse.